根据一线作战部队使用后的要求，M3A1冲锋枪还取消了左机匣上的管状油壶收纳处，在握把内增设了放置保养冲锋枪时使用的枪油筒。使用时转动握把下面枪油筒的旋盖，就可以取下旋盖，而旋盖上有固定的旋杆，能够带出一定量的枪油，可随时保养枪支。 M3在往30发容量的双排单进弹匣内装弹时，用力比较大，M3A1对此进行了改进，使枪托抵肩部位具备了可作为枪弹装填器的功能。在保养枪支时，枪托前部的直杆可以作为擦枪杆使用，而在分解枪管时，还可以作为扳手使用，方便快捷。另外，在1944年，通用公司还为美国战略情报局生产了微声型M3冲锋枪。该枪在枪管上钻有48个直径为6.35毫米的小孔，并装上了消音器。不过，该枪生产数量非常少，只是作为特种枪支使用。
